Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmprss11cQ1JRP2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms