Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms