Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms