Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms