Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms