Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms