Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mesp1P97309 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms