Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms