Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms