Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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