Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rps28P62858 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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