Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Polr2iP60898 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms