Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms