Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.8 ms