Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RxrbP28704 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RxrbP28704 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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