Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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