Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms