Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NefhP19246 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NefhP19246 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms