Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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