Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou4f1P17208 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms