Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms