Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FosbP13346 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FosbP13346 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FosbP13346 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms