Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms