Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtaP09225 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtaP09225 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LtaP09225 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LtaP09225 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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