Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04214 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04214 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04214 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04214 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04214 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04214 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04214 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04214 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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