Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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