Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DffaO54786 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffaO54786 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffaO54786 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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