Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcshO08795 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcshO08795 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcshO08795 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcshO08795 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcshO08795 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PrkcshO08795 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PrkcshO08795 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms