Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm8356J3QPD3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm8356J3QPD3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm8356J3QPD3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm8356J3QPD3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm8356J3QPD3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm8356J3QPD3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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