Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NpcdF8VQB8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NpcdF8VQB8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms