Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn5F6UCX4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms