Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syce3B5KM66 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms