Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms