Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf1B2RRD7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms