Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc163A2AGD7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms