Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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