Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3238W4VSP7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3238W4VSP7 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm3238W4VSP7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm3238W4VSP7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm3238W4VSP7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm3238W4VSP7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3238W4VSP7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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