Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top3bQ9Z321 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms