Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sfrp4Q9Z1N6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sfrp4Q9Z1N6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfrp4Q9Z1N6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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