Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ntn3Q9R1A3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ntn3Q9R1A3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms