Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms