Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms