Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scamp5Q9JKD3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms