Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ybx3Q9JKB3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms