Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lmbr1Q9JIT0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lmbr1Q9JIT0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lmbr1Q9JIT0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lmbr1Q9JIT0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lmbr1Q9JIT0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lmbr1Q9JIT0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lmbr1Q9JIT0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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