Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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