Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clstn1Q9EPL2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms