Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capns2Q9D7J7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms