Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms