Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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